鲑鳟遗传育种与陆海接力养殖联合攻关创新团队与盐碱水域养殖品种开发与利用创新团队合作，完成黑龙江茴鱼染色体水平的高质量基因组图谱。相关成果“A high-quality chromosome-level genome assembly and annotation of the Amur grayling (Thymallus grubii)”在JCR1区期刊《Scientific Data》发表。

黑龙江茴鱼（Thymallus grubii）是东亚淡水流域特有的经济鱼类，在鲑科鱼类进化研究中发挥重要作用。与经历了大量染色体融合的其他鲑科鱼类（如大西洋鲑、虹鳟等）不同，茴鱼属鱼类保留了较高的染色体数目，为研究基因组复制后的不同进化路径提供了独特模型。然而，黑龙江茴鱼此前缺乏高质量的基因组资源，限制了相关比较基因组学与分子育种研究。

本研究综合利用PacBio HiFi长读长测序、Hi-C染色质构象捕获和转录组测序技术，成功构建了黑龙江茴鱼的高质量基因组。最终组装基因组大小为1.75 Gb，包含46条伪染色体，序列锚定率达到99.97%。组装连续性强，contig N50达到3.03 Mb。基因注释共预测到31,867个蛋白质编码基因，其中97.58%的基因获得了功能注释。重复序列占基因组的52.64%，与鲑科鱼类基因组特征一致。该基因组的解析证实，黑龙江茴鱼与欧洲茴鱼类似，在进化过程中主要通过染色体倒位等染色体内重排来维持近乎祖先状态的高染色体数目，而非广泛的染色体融合事件。这为了解全基因组复制后基因组的稳定性维持提供了新的进化视角。

本研究成果不仅为鲑科鱼类比较基因组学和进化生物学的研究提供了重要资源，也将直接服务于黑龙江茴鱼的人工繁育、品种改良以及野生种群的遗传保护，对我国冷水性鱼类产业高质量发展和生物多样性保护具有重要价值。

本研究得到中央级公益性科研院所基本科研业务费（HSY202513Q）、农业农村部国家现代农业产业技术体系（CARS-46）等项目的资助。